El tan esperado reencuentro

Sasori, antes de morir les reveló a Sakura y Chiyo el lugar y momento de una reunión con un espía que había introducido en las filas de Orochimaru. El equipo de Kakashi vuelve a Konoha, y para la nueva misión, conseguir información sobre Orochimaru, Tsunade se ve obligada a hacer cambios en el equipo de Naruto y Sakura. Kakashi, que ha quedado muy debilitado tras usar el Mangekyō Sharingan en la lucha con Deidara, es sustituido por Yamato. Además, debido a la presión impuesta por Danzō, uno de los ancianos de la aldea, antiguo enemigo del tercer Hokage y líder de una parte del ANBU, la raíz, Sai pasa a ocupar el puesto dejado por Sasuke. El nuevo equipo parte al lugar que Sasori les indicó, quedando patente en el camino que Sai es alguien peculiar que pronto se enemista con sus compañeros. Yamato se disfraza como Sasori para engañar al espía, que resulta ser Kabuto Yakushi. Éste les descubre gracias a la aparición de Orochimaru y revela que en realidad se pasó al bando del Sannin tiempo atrás. Naruto, enfurecido con Orochimaru por retener a Sasuke, libera de manera inconsciente parte del chakra de kyubi, llegando hasta mostrar la cuarta cola del zorro. Tras obligar a Orochimaru a huir debido a la gran fuerza del zorro, Yamato consigue sellar de nuevo el chakra de éste en Naruto con la técnica Mokuton, que había heredado del primer Hokage por haber sido una vez sujeto de experimentos de Orochimaru. Antes de salir huyendo el Sannin, Sai se le muestra como espía de Danzō, y se marcha con él puesto que el anciano desea forjar una alianza con Orochimaru. Los ninjas de Konoha les persiguen y averiguan el paradero de Sasuke. Naruto con sus compañeros, que se han infiltrado, atrapan a Sai, pero al aparecer , el supuesto traidor inmoviliza al sirviente de Orochimaru, Kabuto, permitiendo que puedan ir todos a buscar a Sasuke. Sai, que es el primero en dar con él, muestra que su verdadera misión es darle muerte por ser un peligro para la aldea. Tras una gran explosión que hace saltar parte de la guarida subterránea por los aires, todos los demás acuden y Naruto y Sakura se encuentran con Sasuke, que se muestra indiferente a ellos. Éste ataca a Naruto, e incluso consigue neutralizar por completo el chakra del zorro, dejando a Naruto fuera de combate. Sasuke, que se disponía a realizar una técnica desconocida, es detenido por Orochimaru, que les fuerza a retirarse aduciendo que los de Konoha pueden ser más útiles vivos para que puedan acabar con los miembros de Akatsuki.